Důležitou prioritou VUOS a.s. je ochrana životního prostředí. S podporou EU VUOS a.s. zahájil (kromě řady jiných) projekty na zlepšení kvality odpadních vod. V rámci strukturálních fondů EU byl zahájen projekt RESCUP. Jedná se o projekt rozšiřující výzkumnou kapacitu VUOS a.s. a zlepšující úroveň přístrojového vybavení nezbytného pro tyto činnosti.